顕微写真パノラマの作成

機器

Nikon D810

LMScope 三眼アダプター

OMAX 三眼金属顕微鏡

Photogenic Ion リチウムイオン純正弦波インバーターシステム

ソフトウェア

digiCamControl ソフトウェア

Nikon Photo Converter

Zerene Stacker

Picture Window Pro

GIMP

NoMachine

ImageMagick

プロセス

1. LMScope アダプターを Nikon D810 にセットアップする。Nikon D810 をコンピュータに接続し、digiCamControl を開いてセットアップする。

2. 光源の強度とカメラの露出時間を調整する。

3. digiCamControl のライブビューで薄片の適切なコーナーを見つける。

4. ライブビューで適切な開始焦点(ぼけすぎず、いくつかの物体が合焦している状態)を見つける。

5. 写真を撮る。

6. 焦点リングをわずかに回して、より多くの物体を合焦させる。

7. 写真を撮る。

8. すべての物体がボケるまで手順 6 から 7 を繰り返す。

9. ライブビューを監視しながら顕微鏡ステージを上下に移動させ、新しい画像が視野に入ってくるまで行う。前の視野とのオーバーラップがあることを確認する。

10. 薄片の上部/下部に到達するまで手順 4 から 9 を繰り返す。

11. 顕微鏡ステージを左右に移動させ、前の行/列の視野とのオーバーラップのある新しい視野を得るまで行う。

12. 薄片の反対側に到達するまで手順 4 から 11 を繰り返す。

13. 薄い切片を全く見えない純粋な黒い偏光の画像をいくつか撮る。将来的な編集に役立つ可能性があるため。

14. 完了。片付ける。

手順 9 と 11 に関する注記:アイデアは、手動での継ぎ目が可能になるように、薄片全体をオーバーラップするグリッドの画像をキャプチャすることです。

15. 画像グリッドの行/列用のフォルダーをコンピュータ上に作成する。

16. この行/列の Raw Nikon ファイルを TIFF に変換し、このフォルダーに配置する。

17. 行/列フォルダー内で、画像グリッドの各セル(つまり、各視野のすべての異なる焦点キャプチャ)用の個別フォルダーを作成する。これは Zerene Stacker のバッチ処理機能を使用するためである。

18. 各行/列について手順 15 から 17 を繰り返す。

19. フォルダーをバッチとして Zerene Stacker に送信し、フォーカススタッキングが完了するのを待つ。

20. 各行/列のフォルダーに整理された、グリッド全体のスタック画像の完全なセットが現在あるはずです。

21. Picture Window Pro で画像をバッチ後処理する(このステップは撮影者によってカスタマイズ可能です。ホワイトバランス、シャープネス、レンズ歪み補正、その他のウィジェットを追加することを検討してください。更新:Zerene Stacker でのスタッキング前に画像にレンズ歪み補正を適用すると、最良の結果が得られることがわかりました)。

22. 後処理が施され、継ぎ目用に準備されたフォーカススタック画像の完全なセットが現在あるはずです。

23. 画像の行/列を GIMP にインポートする。(自動継ぎ目に成功するソフトウェアが見つからなかったため、手動継ぎ目を選択しています)。

24. GIMP 内で移動とブレンドツールを使用して画像を継ぎ合わせる。

25. 各行/列について手順 23 から 24 を繰り返す。

26. 高速検索とバックアップのためにクラウドストレージに行/列をアップロードする。

27. Amazon で 16 プロセッサと 255 GB の RAM を備えたクラウドコンピュータを設定する(または約 120 GB 以上の RAM を備えた強力なコンピュータ)。

28. サーバーとクライアントに NoMachine をインストールする。

29. クラウドストレージからクラウドコンピュータに行/列をダウンロードする。

30. クラウドコンピュータで GIMP を開く。

31. 各行/列を GIMP の新しいレイヤーとしてインポートする。

32. 移動とブレンドツールを使用して各行/列を一緒に継ぎ合わせる。

33. 背景色をレイヤーとして追加する。

34. 最終画像を TIFF としてエクスポートする。

35. ウェブ表示用に最終画像を低パーセンテージにスケーリングする。

注記:画像が大きすぎる場合、つまり 4 GB より大きい場合、GIMP で TIFF として 1 つのピースでエクスポートできません。(2022 年 6 月更新:GIMP の最新バージョン 2.10.32 は BigTIFF のインポートとエクスポートをサポートしているため、このステップは現在オプションです)。したがって、GIMP では水平/垂直ガイドラインを追加し、画像ギロチンツールを使用して個別の画像をエクスポートする必要があります。次に、ImageMagick で以下のコマンドを使用します。

convert Image1.tiff Image2.tiff … -append TIFF64:Output.tiff

36. krpano 画像を作成する。

37. Gigapan にアップロードする。

注記:Gigapan は大きな TIFF ファイルを好まないため、ImageMagick を使用して画像を TIFF から PSB に変換してからアップロードしてください。

不明な点があればお知らせください。